Được thành lập 1/1999. Tới nay, trung tâm Công nghệ thông tin Y học của trường Đại học Y Hà Nội đã và đang từng bước xây dựng và phát triển, phục vụ đắc lực cho nhiệm vụ công tác của Nhà trường. Hệ thống mạng cục bộ của trường đã được đầu tư và đang đi vào vận hành với những tính năng ưu việt và là kho lưu trữ tài nguyên chung cho toàn bộ các phòng ban trong trường. Bên cạnh đó, hệ thống mạng còn chia sẻ dịch vụ mạng cho một số phòng ban có nhu cầu đặc biệt cần sử dụng để hợp tác quốc tế thông qua mạng toàn cầu Internet. Do vậy, nguồn tư liệu, sự hợp tác về nhiều mặt được phát triển mạnh, đáp ứng được yêu cầu cấp thiết của trường đối với công tác đào tạo và nghiên cứu khoa học.

Do sự phát triển, vị trí, chức năng, nhiệm vụ, hiệu quả phục vụ và điều kiện khách quan, ngày 7/1/1999 Phó Giáo sư Tôn Thất Bách - Hiệu trưởng nhà trường ký quyết định thành lập Trung tâm Công nghệ thông tin Y học. Là một đơn vị độc lập, trực thuộc Hiệu trưởng, với tên gọi: “Trung tâm Công nghệ thông tin y học”

Chủ động, sáng tạo, được sự giúp đỡ, quan tâm của lãnh đạo, hơn một năm qua Trung tâm công nghệ thông tin Y học đã phát triển và trở thành Trung tâm Công nghệ Thông tin Y học của ngành Y tế ở khu vực Hà Nội.

Việc thành lập Trung tâm Công nghệ Thông tin y học - Đại học Y Hà Nội sẽ tạo nên một vị thế mới, tương xứng với vị trí trường trọng điểm quốc gia, thuận lợi hơn trong việc thực thi nhiệm vụ chính trị của trường, góp phần thực hiện nhiệm vụ của trường nói riêng, của ngành y tế nói chung.

Tạo nên sự tương quan giữa các Trung tâm Công nghệ Thông tin Y học trong vùng, Bộ Y tế và các quốc gia khác trao đổi tư liệu, thông tin và hoạt động đối ngoại tạo điều kiện để hoà nhập vào mạng Thông tin Quốc tế và khu vực.

Phát huy tối đa nội lực của đơn vị, đồng thời tập hợp được sự cộng tác về nhiều mặt của cán bộ, của sinh viên trong việc tổ chức và hoạt động...

Chức năng và nhiệm vụ

1- Chức năng:
- Vận hành hệ thống mạng cục bộ trong nhà trường. Cung cấp các dịch vụ chia sẻ tài nguyên qua mạng cho các máy thành viên tham gia mạng.
- Xây dựng một hệ thống phầm mềm quản lý ứng dụng trong môi trường mạng (Quản lý sinh viên, quản lý học viên, quản lý cán bộ, quản lý trang thiết bị vật tư,.....).
- Xây dựng, biên tập và khai thác và thông tin nội dung các tư liệu đưa lên trang Web để phục vụ cho nhiệm vụ của Nhà trường.

2- Nhiệm vụ:
-Xây dựng kế hoạch và tham mưu cho Ban giám hiệu trong việc ứng dụng khoa học tiên tiến của công nghệ thông tin như việc thu thập thông tin, quản lý thông tin, xử lý thông tin và truyền nhận thông tin theo cách nào đó nhằm đạt được ở mức độ tốt nhất mục tiêu đặt ra của Nhà trường.
-Xây dựng kế hoạch khai thác thông tin cho mọi phòng ban theo yêu cầu.
-Trang bị những kiến thức cần thiết về sử dụng và quản lý thông tin, công nghệ thông tin cho mọi người đặc biệt là cho cán bộ công chức trước hết là lực lượng lãnh đạo là hết sức cần thiết nhất là trong công cuộc công nghiệp hoá, hiện đại hoá nhằm xây dựng chủ nghĩa xã hội mà Đảng và chính phủ đã đề ra.
-Lưu dữ và bảo mật các dữ liệu của toàn trường trên hệ thống máy chủ của mạng cục bộ.
-Nâng cao vị thế của Nhà trường, phục vụ cho công tác ngoại giao trong và ngoài nước qua việc xây dựng giới thiệu về Trường Đại Học Y Hà Nội qua Website của Nhà trường trên mạng Internet.
-Xây dựng các phần mềm để hỗ trợ các ứng dụng đa phương tiện, học tập từ xa và đảm bảo truyền thông hiệu quả hơn cũng như các phầm mềm ứng dụng cho công tác quản lý.
-Có kế hoạch đào tạo và bồi dưỡng cán bộ của trung tâm về các mặt: Chính trị, chuyên môn nghiệp vụ, quản lý ngoại ngữ đủ trình độ để điều hành và thực thi nhiệm vụ của đơn vị.
-Tổ chức trao đổi thông tin và tham gia các hoạt động nghiệp vụ của ngành, các cơ quan liên quan, các trường đại học, các tổ chức trong nước, trong khu vực và các nước khác.

Tiềm năng hiện có

1- Có kinh nghiệm về tổ chức và hoạt động.

2- Đội ngũ nhân viên nhiệt tình, có trình độ và ý thức trách nhiệm có tinh thần đoàn kết, năng động và hợp tác trong bất kỳ tình huống nào.

3- Địa điểm nầm ở tầng 2 bên trong thư viên.

4- Công tác nghiệp vụ tương đối hoàn chỉnh: Xử lý kỹ thuật, vận hành mạng, cùng một số máy móc: Có 2 máy chủ, 1 máy in, 1 máy tính PC, nối mạng Internet...

5- Có sự quan tâm của Đảng uỷ, của Ban giám hiệu, và của đông đảo cán bộ và sinh viên trong trường.

Để hoàn thành nhiệm vụ trên, trách nhiệm của Trung tâm Công nghệ Thông tin khá nặng nề. Việc hoàn thành nhiệm vụ của Trung tâm CNTT là một trong những yếu tố quyết định sự thành công đối với nhiệm vụ đào tạo và nghiên cứu khoa học của trường từng bước ứng dụng nền khoa học tiên tiến từ nay đến nay đến năm 2010 và những năm tiếp theo, củng cố và nâng cao vị thế của trường Đại học Y Hà Nội, tương xứng với những kinh nghiệm và quá trình lịch sử 100 năm tồn tại và trưởng thành của nhà trường.